قصة الفيلم تبدأ بلغز في رسالة أرسلها كايتو كيد إلى الشرطة متحديًا من سرقة بيضة ثمينة تسمى بـ "بيضة الذكريات"، والتي سيتم عرضها في متحف سوزوكي والد سونوكو سوزوكي ، وفي يوم السرقة؛ كيد يسرق البيضة بنجاح ويفر بطائرته الشراعية، ولكن يتمكن كونان ايدوغاوا وهيجي هاتوري من مطاردته. وفي منتصف المطاردة؛ تم إطلاق النار على عين كايتو كيد اليمنى بواسطة شخص مجهول. فيقع في البحر مما يدل على وفاته. لكن جهود الشرطة لم تفلح في البحث عن جثته. وتسترجع البيضة الثمينة التي سقطت، يخرج كايتو من البحر بطريقة ما ، ويتنكر بهيئة شيراتوري ويتنصت على حديث كونان مع البروفيسور أغاسا فيكتشف حقيقته ، ثم يقتل القاتل المجهول شخصين آخرين ، ويحاول قتل كوغورو وابنته ران ، لكن كونان ينقذهما ، ويستطيع خداع القاتل بربطة العنق المغيرة للأصوات ، ويكشف هوية القاتل والدافع لذلك ، فيكون القاتل هو امرأة تدعى سيران ، ويستطعيون استعادة البيضة منها ، ويقبضون على سيران والتي تلقب بالعقرب ، ثم يكون كونان على وشك كشف هويته الحقيقية لران ، ولكن كايتو ينقذه من هذا الموقف بتنكره بهيئة كودو شينتشي لتبقى حقيقته سراً.
